بزرگترین و دقیق‌ترین شجره‌نامه تاریخ پرندگان تشکیل شد_دانشجو

یک تیم بین‌المللی از دانشمندان با منفعت گیری از راه حلهای محاسباتی پیشرفته بزرگ‌ترین و دقیق‌ترین شجره‌نامه پرندگان تابه‌امروز را تشکیل کردند. در این پژوهش، پروفسور «سیاوش میرعرب»، محقق ایرانی دانشگاه کالیفرنیا نیز وجود داشته است. این شجره‌نامه شامل نمودار پیچیده‌ای از نزدیک به ۹۳ میلیون سال روابط تکاملی بین ۳۶۳ گونه پرنده است که تقریباً ۹۲ درصد از همه خانواده‌های پرندگان را مشخص می کند.

بر پایه مقاله‌های منتشرشده در نیچر و PNAS، این شجره‌نامه به تفصیل الگوهای تکاملی پرندگان را بعد از انقراضی که دایناسورها را در ۶۵ تا ۶۷ میلیون سال پیش نابود کرد، مشخص می کند. پروفسور میرعرب درمورد این پژوهش می‌گوید:

«مقصد ما بازسازی کل تاریخ تکامل همه پرندگان است.»

درواقع پژوهش حاضر بخشی از پروژه «۱۰۰۰۰ ژنوم پرنده» (B10K) است که در آن دانشگاه کپنهاگ دانمارک، دانشگاه ژجیانگ چین و دانشگاه کالیفرنیا، سن‌دیگو آمریکا همکاری می‌کنند و مقصد آن نیز تشکیل پیش‌نویس توالی ژنوم برای نزدیک به ۱۰,۵۰۰ گونه پرنده حاضر است.

بزرگ‌ترین و دقیق‌ترین شجره‌نامه پرندگان

برای تشکیل این شجره‌نامه، محققان مجموعه‌ای از الگوریتم‌ها به نام ASTRAL منفعت گیری کردند که پروفسور سیاوش میرعرب و همکارانش آن‌ها را برای استنتاج روابط تکاملی، با مقیاس‌پذیری، دقت و سرعتی بی‌سابقه گسترش داده‌اند. با منفعت گیری از این الگوریتم‌ها، محققان داده‌های بیشتر از ۶۰ هزار منطقه ژنومی را ادغام کردند و یک پیکره آماری قوی برای تجزیه‌وتحلیل فراهم کردند.

با پشتیبانی این الگوریتم‌ها، سپس محققان تاریخچه تکاملی قسمت‌های منفرد را بازدید و تشکیل کردند. بعد از آن قسمت‌های جداگانه این درخت را کنار هم قرار دادند و شجرنامه جامع پرندگان را گردآوری کردند. به حرف های محققان، برای بازسازی این شجرنامه از دو استراتژی توالی‌یابی ژن‌های هر گونه و این چنین توالی‌یابی گونه‌های گوناگون منفعت گیری شده است.

این چنین دانشمندان در مطالعات قبلی خود فلامینگوها و کبوترها را به نادرست به‌گفتن خویشاوند تکاملی در کنار هم قرار داده بودند. بااین‌حال، با تکرار تجزیه‌و‌تحلیل ژنوم ۳۶۳ گونه، درخت خانوادگی دقیق‌تری پدید آمد که کبوترها را از فلامینگوها دورتر کرد.